Model | Parameter | ln likelihood | # SPR | CPU time | ||
---|---|---|---|---|---|---|
 |  | Used in simulation | PROCOV estimation |  | trees searched |  |
RAS | α | 0.50 | 0.50 | -4245.78 | 698 | 17 min |
Tuffley-Steel | s01 | 1.875 | 1.66 | -4752.23 | 648 | 14 min |
 | s10 | 1.25 | 0.80 |  |  |  |
Galtier | α | 0.5 | 0.41 | -4188.25 | 673 | 6 hr 52 min |
 | s11 | 1.5 | 2.29 |  |  |  |
 | π | 0.6 | 0.57 |  |  |  |
Huelsenbeck | α | 0.5 | 0.46 | -4070.79 | 648 | 6 hr 8 min |
 | s01 | 1.875 | 1.89 |  |  |  |
 | s10 | 1.25 | 0.83 |  |  |  |
General | α | 0.5 | 0.50 | -4156.24 | 672 | 6 hr 26 min |
 | s01 | 1.5 | 1.00 |  |  |  |
 | s10 | 2 | 1.35 |  |  |  |
 | s11 | 2.5 | 5.35 |  |  |  |
 | π | 0.6 | 0.62 |  |  |  |