TY - JOUR AU - Baker, R. J. AU - Koop, B. F. AU - Haiduk, M. W. PY - 1983 DA - 1983// TI - Resolving systematic relationships with G-bands. A study of five genera of South American Cricetine rodents JO - Syst Zool VL - 32 UR - https://doi.org/10.2307/2413167 DO - 10.2307/2413167 ID - Baker1983 ER - TY - JOUR AU - Patton, J. L. AU - Silva, M. N. AU - Malcolm, J. R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Mammals of the Rio Juruá and the evolutionary and ecological diversification of Amazonia JO - Bul Am Mus Nat Hist VL - 244 ID - Patton2000 ER - TY - JOUR AU - Voss, R. S. AU - Lunde, D. P. AU - Simmons, N. B. PY - 2000 DA - 2000// TI - The mammals of Paracou, French Guiana: a neotropical lowland rainforest fauna. Part 2. Nonvolant species JO - Bull Am Mus Nat Hist VL - 263 ID - Voss2000 ER - TY - JOUR AU - Redi, C. A. AU - Zacharias, H. AU - Merani, S. AU - Oliveira-Miranda, M. AU - Aguilera, M. AU - Zuccotti, M. AU - Garagna, S. AU - Capanna, E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genome Sizes in Afrotheria, Xenarthra, Euarchontoglires, and Laurasiatheria JO - Journal of Heredity VL - 96 UR - https://doi.org/10.1093/jhered/esi080 DO - 10.1093/jhered/esi080 ID - Redi2005 ER - TY - STD TI - da Silva WO, Pieczarka JC, Rossi RV, Schneider H, Sampaio I, Miranda CL, et al. Diversity and karyotypic evolution in the genus Neacomys (Rodentia, Sigmodontinae). Cytogenet Genome Res. 2015. https://doi.org/10.1159/000441173. ID - ref5 ER - TY - JOUR AU - HURTADO, N. A. T. A. L. I. AU - PACHECO, V. Í. C. T. O. R. PY - 2017 DA - 2017// TI - Revision of Neacomys spinosus (Thomas, 1882) (Rodentia: Cricetidae) with emphasis on Peruvian populations and the description of a new species JO - Zootaxa VL - 4242 UR - https://doi.org/10.11646/zootaxa.4242.3.1 DO - 10.11646/zootaxa.4242.3.1 ID - HURTADO2017 ER - TY - JOUR AU - Oliveira Da Silva, W. i. l. l. a. m. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. AU - O’Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Mendes-Oliveira, A. n. a. C. r. i. s. t. i. n. a. AU - Sampaio, I. r. a. c. i. l. d. a. AU - Carneiro, J. e. f. e. r. s. o. n. AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. PY - 2017 DA - 2017// TI - Chromosomal diversity and molecular divergence among three undescribed species of Neacomys (Rodentia, Sigmodontinae) separated by Amazonian rivers JO - PLOS ONE VL - 12 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0182218 DO - 10.1371/journal.pone.0182218 ID - Oliveira Da Silva2017 ER - TY - JOUR AU - Di-Nizo, C. a. m. i. l. l. a. B. r. u. n. o. AU - Banci, K. a. r. i. n. a. R. o. d. r. i. g. u. e. s. d. a. S. i. l. v. a. AU - Sato-Kuwabara, Y. u. k. i. e. AU - Silva, M. a. r. i. a. J. o. s. é. d. e. J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Advances in cytogenetics of Brazilian rodents: cytotaxonomy, chromosome evolution and new karyotypic data JO - Comparative Cytogenetics VL - 11 UR - https://doi.org/10.3897/compcytogen.v11i4.19925 DO - 10.3897/compcytogen.v11i4.19925 ID - Di-Nizo2017 ER - TY - JOUR AU - Sánchez-Vendizú, P. a. m. e. l. a. AU - Pacheco, V. í. c. t. o. r. AU - Vivas-Ruiz, D. a. n. PY - 2018 DA - 2018// TI - An Introduction to the Systematics of Small-Bodied Neacomys (Rodentia: Cricetidae) from Peru with Descriptions of Two New Species JO - American Museum Novitates VL - 3913 UR - https://doi.org/10.1206/3913.1 DO - 10.1206/3913.1 ID - Sánchez-Vendizú2018 ER - TY - JOUR AU - Hice, C. L. AU - Velazco, P. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - The non-volant mammals of the Reserva Nacional Allpahuayo Mishana, Iquitos, Peru. Special Publications JO - Mus Texas Tech Univ VL - 60 ID - Hice2012 ER - TY - JOUR AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. AU - O’Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Pinto, J. a. m. i. l. l. y. A. m. a. r. a. l. AU - Malcher, S. t. e. l. l. a. M. i. r. a. n. d. a. AU - Pereira, A. d. e. n. i. l. s. o. n. L. e. ã. o. AU - das Dores Rissino, J. o. r. g. e. AU - Mendes-Oliveira, A. n. a. C. r. i. s. t. i. n. a. AU - Rossi, R. o. g. é. r. i. o. V. i. e. i. r. a. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. PY - 2013 DA - 2013// TI - FISH with whole chromosome and telomeric probes demonstrates huge karyotypic reorganization with ITS between two species of Oryzomyini (Sigmodontinae, Rodentia): Hylaeamys megacephalus probes on Cerradomys langguthi karyotype JO - Chromosome Research VL - 21 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-013-9341-4 DO - 10.1007/s10577-013-9341-4 ID - Nagamachi2013 ER - TY - JOUR AU - Weksler, M. AU - Percequillo, A. R. AU - Voss, R. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Ten new genera of Oryzomyine rodents (Cricetidae, Sigmodontinae) JO - Am Mus Novitates VL - 3537 UR - https://doi.org/10.1206/0003-0082(2006)3537[1:TNGOOR]2.0.CO;2 DO - 10.1206/0003-0082(2006)3537[1:TNGOOR]2.0.CO;2 ID - Weksler2006 ER - TY - STD TI - Catzeflis F, Tilak M. Molecular systematic of neotropical spiny mice (Neacomys: Sigmodontinae, Rodentia) from the Guiana region. Mammalia. 2009. https://doi.org/10.1515/MAMM.2009.037. ID - ref13 ER - TY - JOUR AU - Percequillo, A. R. AU - Weksler, M. AU - Costa, L. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - A new genus and species of rodent from the Brazilian Atlantic Forest (Rodentia: Cricetidae: Sigmodontinae: Oryzomyini), with comments on oryzomyine biogeography JO - Zool J Linn Soc Lond VL - 161 UR - https://doi.org/10.1111/j.1096-3642.2010.00643.x DO - 10.1111/j.1096-3642.2010.00643.x ID - Percequillo2011 ER - TY - JOUR AU - Ventura, K. AU - O’Brien, P. C. AU - Yonenaga-Yassuda, Y. AU - Ferguson-Smith, M. A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Chromosome homologies of the highly rearranged karyotypes of four Akodon species (Rodentia, Cricetidae) resolved by reciprocal chromosome painting: the evolution of the lowest diploid number in rodents JO - Chromosom Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-009-9083-5 DO - 10.1007/s10577-009-9083-5 ID - Ventura2009 ER - TY - JOUR AU - Graphodatsky, A. AU - Ferguson-Smith, M. A. AU - Stanyon, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - A Short Introduction to Cytogenetic Studies in Mammals with Reference to the Present Volume JO - Cytogenetic and Genome Research VL - 137 UR - https://doi.org/10.1159/000341502 DO - 10.1159/000341502 ID - Graphodatsky2012 ER - TY - STD TI - Ao L, Mao X, Nie W, Gu X, Feng Q, Wang J, et al. Karyotypic evolution and phylogenetic relationships in the order Chiroptera as revealed by G-banding comparison and chromosome painting. Chromosom Res. 2007. https://doi.org/10.1007/s10577-007-1120-7. ID - ref17 ER - TY - JOUR AU - Pieczarka, J. C. AU - Gomes, A. J. B. AU - Nagamachi, C. Y. AU - Rocha, D. C. C. AU - Rissino, J. D. AU - O’Brien, P. C. M. AU - Yang, F. AU - Ferguson-Smith, M. A. PY - 2013 DA - 2013// TI - A phylogenetic analysis using multidirectional chromosome painting of three species (Uroderma magnirostrum, U. bilobatum and Artibeus obscurus) of subfamily Stenodermatinae (Chiroptera-Phyllostomidae) JO - Chromosome Research VL - 21 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-013-9365-9 DO - 10.1007/s10577-013-9365-9 ID - Pieczarka2013 ER - TY - JOUR AU - Ribas, T. a. l. i. t. a. F. e. r. n. a. n. d. a. A. u. g. u. s. t. o. AU - Rodrigues, L. u. i. s. R. e. g. i. n. a. l. d. o. R. i. b. e. i. r. o. AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. AU - Gomes, A. n. d. e. r. s. o. n. J. o. s. é. B. a. i. a. AU - Rissino, J. o. r. g. e. d. a. s. D. o. r. e. s. AU - O'Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Yang, F. e. n. g. t. a. n. g. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. PY - 2015 DA - 2015// TI - Phylogenetic Reconstruction by Cross-Species Chromosome Painting and G-Banding in Four Species of Phyllostomini Tribe (Chiroptera, Phyllostomidae) in the Brazilian Amazon: An Independent Evidence for Monophyly JO - PLOS ONE VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0122845 DO - 10.1371/journal.pone.0122845 ID - Ribas2015 ER - TY - STD TI - Gomes AJB, Nagamachi CY, Rodrigues LRR, Benathar TCM, Ribas TFA, O’Brien PCM, et al. Chromosomal phylogeny of Vampyressine bats (Chiroptera, Phyllostomidae) with description of two new sex chromosome systems. BMC Evol Biol. 2016. https://doi.org/10.1186/s12862-016-0689-x. ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - Hass, I. r. i. s. AU - Sbalqueiro, I. v. e. s. J. o. s. é. AU - Müller, S. t. e. f. a. n. PY - 2008 DA - 2008// TI - Chromosomal phylogeny of four Akodontini species (Rodentia, Cricetidae) from Southern Brazil established by Zoo-FISH using Mus musculus (Muridae) painting probes JO - Chromosome Research VL - 16 UR - https://doi.org/10.1007/s10577-007-1211-5 DO - 10.1007/s10577-007-1211-5 ID - Hass2008 ER - TY - JOUR AU - Suárez, P. a. b. l. o. AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. AU - Lanzone, C. e. c. i. l. i. a. AU - Malleret, M. a. t. i. a. s. M. a. x. i. m. i. l. i. a. n. o. AU - O’Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. PY - 2015 DA - 2015// TI - Clues on Syntenic Relationship among Some Species of Oryzomyini and Akodontini Tribes (Rodentia: Sigmodontinae) JO - PLOS ONE VL - 10 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0143482 DO - 10.1371/journal.pone.0143482 ID - Suárez2015 ER - TY - JOUR AU - Pereira, A. d. e. n. i. l. s. o. n. L. e. ã. o. AU - Malcher, S. t. e. l. l. a. M. i. r. a. n. d. a. AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. AU - O’Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. AU - Mendes-Oliveira, A. n. a. C. r. i. s. t. i. n. a. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. PY - 2016 DA - 2016// TI - Extensive Chromosomal Reorganization in the Evolution of New World Muroid Rodents (Cricetidae, Sigmodontinae): Searching for Ancestral Phylogenetic Traits JO - PLOS ONE VL - 11 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0146179 DO - 10.1371/journal.pone.0146179 ID - Pereira2016 ER - TY - JOUR AU - Malcher, S. t. e. l. l. a. M. i. r. a. n. d. a. AU - Pieczarka, J. u. l. i. o. C. e. s. a. r. AU - Geise, L. e. n. a. AU - Rossi, R. o. g. é. r. i. o. V. i. e. i. r. a. AU - Pereira, A. d. e. n. i. l. s. o. n. L. e. ã. o. AU - O’Brien, P. a. t. r. i. c. i. a. C. a. r. o. l. i. n. e. M. a. r. y. AU - Asfora, P. a. u. l. o. H. e. n. r. i. q. u. e. AU - Fonsêca da Silva, V. i. c. t. o. r. AU - Sampaio, M. a. r. i. a. I. r. a. c. i. l. d. a. AU - Ferguson-Smith, M. a. l. c. o. l. m. A. n. d. r. e. w. AU - Nagamachi, C. l. e. u. s. a. Y. o. s. h. i. k. o. PY - 2017 DA - 2017// TI - Oecomys catherinae (Sigmodontinae, Cricetidae): Evidence for chromosomal speciation? JO - PLOS ONE VL - 12 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0181434 DO - 10.1371/journal.pone.0181434 ID - Malcher2017 ER - TY - JOUR AU - Romanenko, S. A. AU - Volobouev, V. PY - 2012 DA - 2012// TI - Non-Sciuromorph Rodent Karyotypes in Evolution JO - Cytogenetic and Genome Research VL - 137 UR - https://doi.org/10.1159/000339294 DO - 10.1159/000339294 ID - Romanenko2012 ER - TY - JOUR AU - Romanenko, S. A. AU - Perelman, P. L. AU - Trifonov, V. A. AU - Graphodatsky, A. S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Chromosomal evolution in Rodentia JO - Heredity VL - 108 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.2011.110 DO - 10.1038/hdy.2011.110 ID - Romanenko2011 ER - TY - STD TI - Kasahara S. Introdução à Pesquisa em Citogenética de Vertebrados. 1st ed: Ribeirão Preto, SP, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética; 2009. ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - King, M. PY - 1987 DA - 1987// TI - Chromosomal rearrangements, speciation and the theoretical approach JO - Heredity VL - 59 UR - https://doi.org/10.1038/hdy.1987.90 DO - 10.1038/hdy.1987.90 ID - King1987 ER - TY - STD TI - Swier VJ, Bradley RD, Rens W, Elder FFB, Baker RJ. Patterns of chromosomal evolution in Sigmodon, evidence from whole chromosome paints. Cytogenet Genome Res. 2009. https://doi.org/10.1159/000218747. ID - ref29 ER - TY - JOUR AU - Bailey, J. A. AU - Baertsch, R. AU - Kent, W. J. AU - Haussler, D. AU - Eichler, E. E. PY - 2004 DA - 2004// TI - Hotspots of mammalian chromosomal evolution JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-4-r23 DO - 10.1186/gb-2004-5-4-r23 ID - Bailey2004 ER - TY - STD TI - Da Silva WO, Rodrigues da Costa MJ, Pieczarka JC, Rissino J, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Nagamachi CY. Identification of two independent X-autosome translocations in closely related mammalian (Proechimys) species. Sci Rep. 2019. https://doi.org/10.1038/s41598-019-40593-8. ID - ref31 ER - TY - JOUR AU - Pardiñas, U. F. J. AU - Teta, P. AU - Salazar-Bravo, J. PY - 2015 DA - 2015// TI - A new tribe of Sigmodontinae rodents (Cricetidae) JO - Mastozool Neotrop VL - 22 ID - Pardiñas2015 ER - TY - CHAP AU - Corn, P. S. ED - Heyer, W. R. ED - Donnelly, M. A. ED - McDiarmid, R. W. ED - Hayek, L. C. ED - Foster, M. S. PY - 1994 DA - 1994// TI - Straight-line drift fences and pitfall traps BT - Measuring and monitoring biological standard methods for amphibians PB - Smithsonian Institution Press CY - Washington, DC ID - Corn1994 ER - TY - JOUR AU - Ford, C. E. AU - Hamerton, J. L. PY - 1956 DA - 1956// TI - A colchicine, hypotonic – citrate, squash sequence for mammalian chromosomes JO - Stain Technol VL - 31 UR - https://doi.org/10.3109/10520295609113814 DO - 10.3109/10520295609113814 ID - Ford1956 ER - TY - JOUR AU - Sumner, A. T. AU - Evans, H. J. AU - Buckland, R. A. PY - 1971 DA - 1971// TI - New technique for distinguishing between human chromosomes JO - Nature (Lond) New Biol VL - 31 ID - Sumner1971 ER - TY - JOUR AU - Sumner, A. T. PY - 1972 DA - 1972// TI - A simple technique for demonstrating centromeric heterochromatin JO - Exp Cell Res VL - 75 UR - https://doi.org/10.1016/0014-4827(72)90558-7 DO - 10.1016/0014-4827(72)90558-7 ID - Sumner1972 ER - TY - JOUR AU - Levan, A. AU - Fredga, K. AU - Sandberg, A. A. PY - 1964 DA - 1964// TI - Nomenclature for centromeric position on chromosomes JO - Hereditas VL - 52 UR - https://doi.org/10.1111/j.1601-5223.1964.tb01953.x DO - 10.1111/j.1601-5223.1964.tb01953.x ID - Levan1964 ER - TY - BOOK AU - Swofford, D. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - PAUP*. Phylogenetic analysis using parsimony (*and other methods). Version 4 PB - Sinauer Associates CY - Sunderland ID - Swofford2002 ER - TY - JOUR AU - Goloboff, P. A. AU - Farris, J. S. AU - Nixon, K. C. PY - 2008 DA - 2008// TI - T.N.T., a free program for phylogenetic analysis JO - Cladistics VL - 24 UR - https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.2008.00217.x DO - 10.1111/j.1096-0031.2008.00217.x ID - Goloboff2008 ER - TY - BOOK AU - Maddison, W. P. AU - Maddison, D. R. PY - 2018 DA - 2018// TI - Mesquite: a modular system for evolutionary analysis. Version 3.40 ID - Maddison2018 ER - TY - JOUR AU - Rokas, A. AU - Holland, P. W. H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Rare genomic changes as a tool for phylogenetics JO - Trends Ecol Evol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/S0169-5347(00)01967-4 DO - 10.1016/S0169-5347(00)01967-4 ID - Rokas2000 ER -