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Table 1 List of human gene families used in the phylogenetic analysis

From: Evolutionary history of the human multigene families reveals widespread gene duplications throughout the history of animals

Gene family

Members

Chr location

Human protein accession No.

Number of included taxa

Number of sequences included

Antizyme Inhibitor

AZIN2

1p35.1

Q96A70

25

54

ODC1

2p25

P11926

  

AZIN1

8q22.3

O14977

  

Cholinergic Receptors Nicotinic subunits

CHRNB2

1q21.3

P17787

32

123

CHRNG

2q37.1

P07510

  

CHRND

2q37.1

Q07001

  

CHRNA1

2q31.1

P02708

  

CHRNA2

8p21

Q15822

  

CHRNA6

8p11.21

Q15825

  

CHRNB3

8p11.2

Q05901

  

CHRNA4

20q13.33

P43681

  

CHRNA3

15q24

P32297

  

CHRNB4

15q24

P30926

  

CHRNB1

17p13.1

P11230

  

CHRNE

17p13.2

Q04844

  

CHRNA5

15q24

P30532

  

Ciliary Rootlet Coiled-Coil Protein

CROCC

1p36.13

Q5TZA2

28

42

CROCC2

2q37.3

H7BZ55

  

CEP250

20q11.22

Q9BV73

  

Discs, large (Drosophila) Homolog-associated Protein

DLGAP3

1p35.3-p34.1

O95886

25

85

DLGAP1

18p11.31

O14490

  

DLGAP5

14q22.3

Q15398

  

DLGAP2

8p23

Q9P1A6

  

DLGAP4

20q11.23

Q9Y2H0

  

E2F Transcription Factor

E2F2

1p36

Q14209

31

84

E2F6

2p25.1

O75461

  

E2F5

8q21.2

Q15329

  

E2F1

20q11.2

Q01094

  

E2F3

6p22

O00716

  

E2F4

16q22.1

Q16254

  

Family with Sequence Similarity 110

FAM110D

1p36.11

Q8TAY7

25

56

FAM110C

2p25.3

Q1W6H9

  

FAM110B

8q12.1

Q8TC76

  

FAM110A

20p13

Q9BQ89

  

Grainyhead like Transcription factor

GRHL3

1p36.11

Q8TE85

26

57

TFCP2L1

2q14

Q9NZI6

  

GRHL1

2p25.1

Q9NZI5

  

GRHL2

8q22.3

Q6ISB3

  

TFCP2

12q13

Q12800

  

UBP1

3p22.3

Q9NZI7

  

Inhibitor of DNA Binding protein

ID3

1p36.13-p36.12

Q02535

35

65

ID2

2p25

Q02363

  

ID1

20q11

P41134

  

ID4

6p22.3

P47928

  

Maestro Heat-like Repeat-containing Protein Family

MROH9

1q24.3

Q5TGP6

22

46

MROH7

1p32.3

Q68CQ1

  

MROH6

8q24.3

A6NGR9

  

MROH5

8q24.3

Q6ZUA9

  

MROH8

20q11.22

Q9H579

  

Myelin Transcription Factor

MYT1L

2p25.3

Q9UL68

22

48

ST18

8q11.23

O60284

  

MYT1

20q13.33

Q01538

  

Nuclear Receptor Coactivator

NCOA1

2p23

Q15788

22

54

NCOA2

8q13.3

Q15596

  

NCOA3

20q12

Q9Y6Q9

  

Na+/K+ Transporting ATPase Interacting Protein

NKAIN1

1p35.2

Q4KMZ8

24

46

NKAIN3

8q12.3

Q8N8D7

  

NKAIN4

20q13.33

Q8IVV8

  

NKAIN2

6q21

Q5VXU1

  

Potassium Voltage-Gated Channel subfamily Q

KCNQ4

1p34

P56696

28

67

KCNQ3

8q24

O43525

  

KCNQ2

20q13.3

O43526

  

KCNQ5

6q14

Q9NR82

  

KCNQ1

11p15.5

P51787

  

Regulator of G-protein Signalling

RGS13

1q31.2

O14921

31

101

RGS8

1q25

P57771

  

RGS1

1q31

Q08116

  

RGS18

1q31.2

Q9NS28

  

RGS16

1q25-q31

O15492

  

RGS21

1q31.2

Q2M5E4

  

RGS4

1q23.3

P49798

  

RGS2

1q31

P41220

  

RGS20

8q11.23

O76081

  

RGS19

20q13.33

P49795

  

RGS17

6q25.3

Q9UGC6

  

RGS3

9q32

P49796

  

RGS5

1q23.1

O15539

  

Regulating Synaptic Membrane Exocytosis Protein

RIMS3

1p34.2

Q9UJD0

27

49

RIMS2

8q22.3

Q9UQ26

  

RIMS4

20q13.12

Q9H426

  

RIMS1

6q12-q13

Q86UR5

  

R-Spondin Homolog

RSPO1

1p34.3

Q2MKA7

31

60

RSPO2

8q23.1

Q6UXX9

  

RSPO4

20p13

Q2I0M5

  

RSPO3

6q22.33

Q9BXY4

  

Solute Carrier Family

SLC30A2

1p35.3

Q9BRI3

23

74

SLC30A10

1q41

Q6XR72

  

SLC30A1

1q32.3

Q9Y6M5

  

SLC30A3

2p23.3

Q99726

  

SLC30A8

8q24.11

Q8IWU4

  

SLC30A4

15q21.1

O14863

  

Syntrophin, Gamma

SNTG2

2p25.3

Q9NY99

28

81

SNTG1

8q11.21

Q9NSN8

  

SNTB1

8q23-q24

Q13884

  

SNTA1

20q11.2

Q13424

  

SNTB2

16q22.1

P49711

  

GOPC

6q21

Q9HD26

  

Sorting Nexin Family

SNX27

1q21.3

Q96L92

29

43

SNX17

2p23.3

Q15036

  

SNX31

8q22.3

Q8N9S9

  

Stathmin

STMN1

1p36.11

P16949

22

63

STMN2

8q21.13

Q93045

  

STMN4

8p21.2

Q9H169

  

STMN3

20q13.3

Q9NZ72

  

Serine/Threonine-Protein Kinase

STK25

2q37.3

O00506

25

72

STK3

8q22.2

Q13188

  

STK4

20q11.2-q13.2

Q13043

  

STK24

13q31.2-q32.3

Q9Y6E0

  

STK26

Xq26.2

Q9P289

  

Transcription Elongation factor A (SII) Protein

TCEA3

1p36.12

O75764

22

51

TCEA1

8q11.2

P23193

  

TCEA2

20q13.33

Q15560

  

TCEANC

Xp22.2

Q8N8B7

  

UBX Domain-Containing Protein

UBXN2A

2p23.3

P68543

22

32

UBXN2B

8q12.1

Q14CS0

  

NSFL1C

20p13

Q9UNZ2

  

X Kell Blood Group Precursor-related Family

XKR8

1p35.3

Q9H6D3

24

101

XKR9

8q13.3

Q5GH70

  

XKR6

8p23.1

Q5GH73

  

XKR4

8q12.1

Q5GH76

  

XKR5

8p23.1

Q6UX68

  

XKR7

20q11.21

Q5GH72

  

YTH Domain-Containing Family Protein

YTHDF2

1p35

Q9Y5A9

24

50

YTHDF3

8q12.3

Q7Z739

  

YTHDF1

20q13.33

Q9BYJ9

 Â