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Table 1 List of human gene families used in the phylogenetic analysis

From: Evolutionary history of the human multigene families reveals widespread gene duplications throughout the history of animals

Gene family Members Chr location Human protein accession No. Number of included taxa Number of sequences included
Antizyme Inhibitor AZIN2 1p35.1 Q96A70 25 54
ODC1 2p25 P11926   
AZIN1 8q22.3 O14977   
Cholinergic Receptors Nicotinic subunits CHRNB2 1q21.3 P17787 32 123
CHRNG 2q37.1 P07510   
CHRND 2q37.1 Q07001   
CHRNA1 2q31.1 P02708   
CHRNA2 8p21 Q15822   
CHRNA6 8p11.21 Q15825   
CHRNB3 8p11.2 Q05901   
CHRNA4 20q13.33 P43681   
CHRNA3 15q24 P32297   
CHRNB4 15q24 P30926   
CHRNB1 17p13.1 P11230   
CHRNE 17p13.2 Q04844   
CHRNA5 15q24 P30532   
Ciliary Rootlet Coiled-Coil Protein CROCC 1p36.13 Q5TZA2 28 42
CROCC2 2q37.3 H7BZ55   
CEP250 20q11.22 Q9BV73   
Discs, large (Drosophila) Homolog-associated Protein DLGAP3 1p35.3-p34.1 O95886 25 85
DLGAP1 18p11.31 O14490   
DLGAP5 14q22.3 Q15398   
DLGAP2 8p23 Q9P1A6   
DLGAP4 20q11.23 Q9Y2H0   
E2F Transcription Factor E2F2 1p36 Q14209 31 84
E2F6 2p25.1 O75461   
E2F5 8q21.2 Q15329   
E2F1 20q11.2 Q01094   
E2F3 6p22 O00716   
E2F4 16q22.1 Q16254   
Family with Sequence Similarity 110 FAM110D 1p36.11 Q8TAY7 25 56
FAM110C 2p25.3 Q1W6H9   
FAM110B 8q12.1 Q8TC76   
FAM110A 20p13 Q9BQ89   
Grainyhead like Transcription factor GRHL3 1p36.11 Q8TE85 26 57
TFCP2L1 2q14 Q9NZI6   
GRHL1 2p25.1 Q9NZI5   
GRHL2 8q22.3 Q6ISB3   
TFCP2 12q13 Q12800   
UBP1 3p22.3 Q9NZI7   
Inhibitor of DNA Binding protein ID3 1p36.13-p36.12 Q02535 35 65
ID2 2p25 Q02363   
ID1 20q11 P41134   
ID4 6p22.3 P47928   
Maestro Heat-like Repeat-containing Protein Family MROH9 1q24.3 Q5TGP6 22 46
MROH7 1p32.3 Q68CQ1   
MROH6 8q24.3 A6NGR9   
MROH5 8q24.3 Q6ZUA9   
MROH8 20q11.22 Q9H579   
Myelin Transcription Factor MYT1L 2p25.3 Q9UL68 22 48
ST18 8q11.23 O60284   
MYT1 20q13.33 Q01538   
Nuclear Receptor Coactivator NCOA1 2p23 Q15788 22 54
NCOA2 8q13.3 Q15596   
NCOA3 20q12 Q9Y6Q9   
Na+/K+ Transporting ATPase Interacting Protein NKAIN1 1p35.2 Q4KMZ8 24 46
NKAIN3 8q12.3 Q8N8D7   
NKAIN4 20q13.33 Q8IVV8   
NKAIN2 6q21 Q5VXU1   
Potassium Voltage-Gated Channel subfamily Q KCNQ4 1p34 P56696 28 67
KCNQ3 8q24 O43525   
KCNQ2 20q13.3 O43526   
KCNQ5 6q14 Q9NR82   
KCNQ1 11p15.5 P51787   
Regulator of G-protein Signalling RGS13 1q31.2 O14921 31 101
RGS8 1q25 P57771   
RGS1 1q31 Q08116   
RGS18 1q31.2 Q9NS28   
RGS16 1q25-q31 O15492   
RGS21 1q31.2 Q2M5E4   
RGS4 1q23.3 P49798   
RGS2 1q31 P41220   
RGS20 8q11.23 O76081   
RGS19 20q13.33 P49795   
RGS17 6q25.3 Q9UGC6   
RGS3 9q32 P49796   
RGS5 1q23.1 O15539   
Regulating Synaptic Membrane Exocytosis Protein RIMS3 1p34.2 Q9UJD0 27 49
RIMS2 8q22.3 Q9UQ26   
RIMS4 20q13.12 Q9H426   
RIMS1 6q12-q13 Q86UR5   
R-Spondin Homolog RSPO1 1p34.3 Q2MKA7 31 60
RSPO2 8q23.1 Q6UXX9   
RSPO4 20p13 Q2I0M5   
RSPO3 6q22.33 Q9BXY4   
Solute Carrier Family SLC30A2 1p35.3 Q9BRI3 23 74
SLC30A10 1q41 Q6XR72   
SLC30A1 1q32.3 Q9Y6M5   
SLC30A3 2p23.3 Q99726   
SLC30A8 8q24.11 Q8IWU4   
SLC30A4 15q21.1 O14863   
Syntrophin, Gamma SNTG2 2p25.3 Q9NY99 28 81
SNTG1 8q11.21 Q9NSN8   
SNTB1 8q23-q24 Q13884   
SNTA1 20q11.2 Q13424   
SNTB2 16q22.1 P49711   
GOPC 6q21 Q9HD26   
Sorting Nexin Family SNX27 1q21.3 Q96L92 29 43
SNX17 2p23.3 Q15036   
SNX31 8q22.3 Q8N9S9   
Stathmin STMN1 1p36.11 P16949 22 63
STMN2 8q21.13 Q93045   
STMN4 8p21.2 Q9H169   
STMN3 20q13.3 Q9NZ72   
Serine/Threonine-Protein Kinase STK25 2q37.3 O00506 25 72
STK3 8q22.2 Q13188   
STK4 20q11.2-q13.2 Q13043   
STK24 13q31.2-q32.3 Q9Y6E0   
STK26 Xq26.2 Q9P289   
Transcription Elongation factor A (SII) Protein TCEA3 1p36.12 O75764 22 51
TCEA1 8q11.2 P23193   
TCEA2 20q13.33 Q15560   
TCEANC Xp22.2 Q8N8B7   
UBX Domain-Containing Protein UBXN2A 2p23.3 P68543 22 32
UBXN2B 8q12.1 Q14CS0   
NSFL1C 20p13 Q9UNZ2   
X Kell Blood Group Precursor-related Family XKR8 1p35.3 Q9H6D3 24 101
XKR9 8q13.3 Q5GH70   
XKR6 8p23.1 Q5GH73   
XKR4 8q12.1 Q5GH76   
XKR5 8p23.1 Q6UX68   
XKR7 20q11.21 Q5GH72   
YTH Domain-Containing Family Protein YTHDF2 1p35 Q9Y5A9 24 50
YTHDF3 8q12.3 Q7Z739   
YTHDF1 20q13.33 Q9BYJ9