Multiple refugia from penultimate glaciations in East Asia demonstrated by phylogeography and ecological modelling of an insect pest

Song, Wei; Cao, Li-Jun; Li, Bing-Yan; Gong, Ya-Jun; Hoffmann, Ary Anthony; Wei, Shu-Jun

doi:10.1186/s12862-018-1269-z

Table 2 F_ST values calculated in FREENA based on microsatellite loci

From: Multiple refugia from penultimate glaciations in East Asia demonstrated by phylogeography and ecological modelling of an insect pest

Population	BJPG	FJND	GDGZ	GSTS	GXNN	GZGY	HNCS	LNSY	QHHD	SCBZ	SCCD	SCGY	SCNC	SDQD	SXYA	YNBS	YNHH	YNKM	YNPE	YNQJ	ZJNB
BJPG	–	0.035	0.193	0.068	0.081	0.069	0.021	0	0.045	0.065	0.078	0.083	0.095	0.025	0.02	0.108	0.135	0.088	0.213	0.131	0.027
FJND	0.032	–	0.175	0.054	0.073	0.06	0.014	0.042	0.053	0.067	0.065	0.075	0.081	0.039	0.054	0.112	0.106	0.11	0.197	0.14	0.031
GDGZ	0.218	0.193	–	0.194	0.192	0.126	0.155	0.181	0.16	0.165	0.164	0.164	0.181	0.206	0.17	0.157	0.19	0.164	0.2	0.168	0.154
GSTS	0.076	0.067	0.222	–	0.1	0.041	0.049	0.074	0.025	0.053	0.04	0.022	0.062	0.061	0.05	0.111	0.165	0.117	0.188	0.13	0.024
GXNN	0.082	0.078	0.211	0.108	–	0.052	0.087	0.092	0.109	0.091	0.085	0.089	0.084	0.122	0.122	0.128	0.16	0.13	0.228	0.14	0.083
GZGY	0.067	0.064	0.139	0.046	0.05	–	0.048	0.068	0.049	0.033	0.019	0.019	0.037	0.089	0.07	0.063	0.116	0.075	0.123	0.065	0.033
HNCS	0.034	0.015	0.175	0.058	0.099	0.051	–	0.038	0.036	0.054	0.058	0.05	0.067	0.019	0.021	0.091	0.106	0.086	0.176	0.124	0.016
LNSY	−0.005	0.044	0.208	0.091	0.097	0.07	0.054	–	0.061	0.075	0.082	0.086	0.105	0.039	0.044	0.108	0.134	0.098	0.195	0.138	0.042
QHHD	0.052	0.057	0.183	0.024	0.112	0.051	0.04	0.074	–	0.058	0.06	0.052	0.078	0.033	0.029	0.084	0.134	0.07	0.175	0.111	0.022
SCBZ	0.074	0.077	0.181	0.064	0.106	0.04	0.063	0.092	0.066	–	0.011	0.013	0.012	0.071	0.061	0.098	0.172	0.108	0.175	0.105	0.02
SCCD	0.076	0.068	0.176	0.039	0.087	0.022	0.053	0.088	0.069	0.01	–	0.004	0.01	0.085	0.07	0.09	0.16	0.113	0.176	0.109	0.019
SCGY	0.079	0.075	0.177	0.018	0.089	0.018	0.045	0.089	0.046	0.009	0	–	0.012	0.089	0.06	0.092	0.162	0.109	0.155	0.101	0.023
SCNC	0.097	0.083	0.195	0.063	0.094	0.046	0.067	0.115	0.078	0.007	0.011	0.011	–	0.101	0.08	0.11	0.175	0.124	0.191	0.122	0.035
SDQD	0.037	0.039	0.225	0.063	0.133	0.088	0.023	0.049	0.032	0.084	0.084	0.083	0.1	–	0.026	0.114	0.166	0.101	0.22	0.157	0.023
SXYA	0.014	0.057	0.191	0.054	0.124	0.074	0.029	0.039	0.028	0.067	0.074	0.062	0.083	0.02	–	0.083	0.13	0.09	0.191	0.118	0.018
YNBS	0.124	0.128	0.177	0.128	0.132	0.064	0.107	0.128	0.098	0.109	0.097	0.09	0.117	0.13	0.091	–	0.074	0.062	0.067	0.058	0.069
YNHH	0.148	0.114	0.218	0.186	0.156	0.108	0.124	0.155	0.15	0.182	0.158	0.16	0.177	0.185	0.143	0.089	–	0.098	0.098	0.073	0.142
YNKM	0.108	0.124	0.189	0.143	0.139	0.081	0.105	0.122	0.091	0.13	0.129	0.117	0.139	0.123	0.106	0.071	0.109	–	0.106	0.064	0.091
YNPE	0.236	0.216	0.229	0.215	0.236	0.119	0.193	0.231	0.196	0.19	0.179	0.157	0.197	0.246	0.21	0.066	0.109	0.113	–	0.054	0.178
YNQJ	0.149	0.161	0.2	0.156	0.151	0.068	0.146	0.163	0.134	0.124	0.122	0.108	0.136	0.183	0.139	0.07	0.076	0.079	0.058	–	0.108
ZJNB	0.027	0.035	0.169	0.026	0.087	0.037	0.018	0.043	0.028	0.028	0.025	0.022	0.041	0.017	0.012	0.076	0.154	0.113	0.194	0.131	–

The upper matrix is F_ST values calculated in FREENA using ENA model; the lower is F_ST values calculated in FREENA without ENA model

Back to article page

ISSN: 2730-7182

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com

BMC Ecology and Evolution

Contact us