From: Transposable element distribution, abundance and role in genome size variation in the genus Oryza
 | O. nivara | O. rufipogon | O. glaberrima | O. punctata | O. officinalis | O. minuta | O. alta | O. australiensis | O. brachyantha | O. granulata | O. coarctata | O. ridleyi |
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COPIA1 | 0.35 | 0.59 | 0.60 | 0.57 | 0.87 | 0.82 | 0.57 | 1.64 | 0.18 | 0.69 | 0.81 | 0.63 |
COPIA2 | 0.19 | 0.39 | 0.26 | 0.19 | 0.27 | 0.35 | 0.54 | 0.45 | 0.12 | 0.70 | 0.21 | 0.27 |
COPIA3 | 0.13 | 0.00 | 0.00 | 0.19 | 0.00 | 0.37 | 0.32 | 0.43 | 0.15 | 0.07 | 0.18 | 0.31 |
COPIO | 0.42 | 0.31 | 0.31 | 0.92 | 0.60 | 0.85 | 0.62 | 0.48 | 0.65 | 0.84 | 0.71 | 0.96 |
Hopscotch | 0.03 | 0.08 | 0.06 | 0.03 | 0.06 | 0.10 | 0.05 | 0.04 | 0.00 | 0.10 | 0.48 | 0.14 |
OSTONOR1 | 0.16 | 0.04 | 0.11 | 0.32 | 0.37 | 0.51 | 0.11 | 0.79 | 0.24 | 0.22 | 0.02 | 0.14 |
RETROFIT4 | 0.10 | 0.00 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.06 | 0.09 | 0.07 | 0.06 | 0.04 | 0.35 | 0.06 |
RIRE1 | 0.06 | 0.00 | 0.00 | 0.16 | 0.10 | 0.60 | 0.61 | 4.38 | 0.03 | 0.49 | 0.23 | 0.46 |
RIRE5 | 0.26 | 0.16 | 0.26 | 0.06 | 0.17 | 0.18 | 0.42 | 0.15 | 0.06 | 0.01 | 0.05 | 0.15 |
SC-1 | 0.06 | 0.04 | 0.11 | 0.10 | 0.17 | 0.26 | 0.46 | 0.71 | 0.09 | 0.34 | 0.04 | 0.37 |
SZ-6 | 0.03 | 0.00 | 0.03 | 0.03 | 0.04 | 0.08 | 0.17 | 0.08 | 0.09 | 0.12 | 2.75 | 0.14 |
ATALANTYS | 1.87 | 1.49 | 1.77 | 6.36 | 10.15 | 8.70 | 7.32 | 10.98 | 0.36 | 7.28 | 4.08 | 7.62 |
BAJIE | 0.26 | 0.39 | 0.66 | 0.54 | 0.74 | 0.49 | 0.45 | 0.15 | 0.00 | 0.04 | 0.04 | 0.22 |
RIREX (Dasheng) | 0.55 | 1.06 | 0.20 | 1.02 | 1.49 | 1.08 | 0.74 | 1.24 | 0.03 | 1.26 | 0.05 | 0.53 |
GYPSY1 | 0.48 | 0.23 | 0.40 | 0.22 | 0.27 | 0.29 | 0.16 | 1.18 | 0.18 | 0.30 | 0.18 | 0.05 |
RETRO2 | 1.68 | 1.10 | 0.26 | 1.08 | 3.03 | 1.31 | 0.72 | 0.54 | 0.06 | 0.96 | 0.16 | 1.97 |
RETROSAT2 | 1.64 | 0.78 | 0.52 | 0.54 | 1.65 | 1.63 | 0.86 | 2.74 | 4.12 | 1.84 | 0.05 | 0.38 |
RETROSAT3 | 0.68 | 0.98 | 0.66 | 0.70 | 1.69 | 1.62 | 1.01 | 2.81 | 2.13 | 1.66 | 0.05 | 0.37 |
RETROSAT4 | 1.29 | 0.78 | 0.54 | 1.02 | 2.76 | 0.88 | 0.70 | 0.84 | 0.03 | 1.75 | 0.22 | 1.12 |
RIRE2 | 1.61 | 1.02 | 0.74 | 1.69 | 4.43 | 2.06 | 1.70 | 8.56 | 0.24 | 21.50 | 0.41 | 2.42 |
RIRE3 | 3.42 | 3.37 | 1.09 | 0.25 | 0.58 | 0.43 | 0.17 | 0.76 | 0.06 | 0.60 | 0.18 | 0.41 |
RIRE8 | 5.90 | 5.21 | 2.55 | 1.18 | 0.78 | 1.08 | 1.49 | 0.86 | 0.24 | 2.59 | 0.29 | 0.31 |
SZ-22 | 0.19 | 0.27 | 0.11 | 0.32 | 0.33 | 0.42 | 0.19 | 0.16 | 0.00 | 0.06 | 0.00 | 0.07 |
SZ-42 | 0.23 | 0.39 | 0.26 | 0.06 | 0.19 | 0.24 | 0.21 | 0.18 | 0.06 | 1.11 | 0.04 | 0.61 |
SZ-50 | 0.77 | 0.47 | 0.49 | 2.19 | 0.06 | 0.85 | 0.07 | 0.03 | 0.00 | 0.36 | 0.12 | 0.06 |
SZ-7 | 1.03 | 0.90 | 1.35 | 0.57 | 1.38 | 1.00 | 0.92 | 0.31 | 0.03 | 1.05 | 0.31 | 0.51 |
UNC | 2.55 | 3.29 | 3.18 | 3.85 | 4.76 | 3.41 | 5.64 | 3.66 | 1.63 | 2.57 | 1.23 | 3.21 |
NHF | 1.32 | 1.14 | 1.32 | 1.53 | 1.84 | 1.85 | 2.31 | 1.59 | 0.71 | 2.08 | 1.50 | 5.55 |
Other Families | 2.19 | 1.54 | 2.57 | 3.69 | 3.03 | 3.11 | 3.46 | 4.86 | 1.18 | 4.35 | 3.15 | 3.70 |