Short-wavelength sensitive opsin (SWS1) as a new marker for vertebrate phylogenetics

Table 2 Base composition and χ2 tests of homogeneity

		A	C	G	T	Avg # bps	χ2	df	p
All sites	Fish	0.214	0.290	0.249	0.247	1008	40.53	48	0.770
	Reptiles	0.165	0.344	0.263	0.228	932.7	18.77	45	1.000
	Mammals	0.191	0.293	0.246	0.271	1029	36.98	69	0.999
	Tetrapods	0.197	0.315	0.242	0.246	995.4	419.3	129	<<0.001
	Vertebrates	0.210	0.306	0.239	0.245	999.6	613.4	183	<<0.001
Codon #1	Fish	0.266	0.160	0.289	0.286	336.0	7.590	48	1.000
	Reptiles	0.235	0.198	0.295	0.271	310.9	8.498	45	1.000
	Mammals	0.242	0.205	0.282	0.272	342.9	12.94	69	1.000
	Tetrapods	0.260	0.198	0.279	0.263	331.8	37.29	129	1.000
	Vertebrates	0.281	0.171	0.279	0.269	333.2	97.57	183	1.000
Codon #2	Fish	0.230	0.262	0.163	0.345	336.0	3.147	48	1.000
	Reptiles	0.220	0.244	0.184	0.352	310.9	10.32	45	1.000
	Mammals	0.221	0.235	0.184	0.359	342.9	5.601	69	1.000
	Tetrapods	0.222	0.244	0.179	0.356	331.8	18.94	129	1.000
	Vertebrates	0.224	0.250	0.176	0.349	333.2	76.50	183	1.000
Codon #3	Fish	0.143	0.392	0.280	0.186	336.6	84.81	48	0.001
	Reptiles	0.050	0.588	0.311	0.051	310.8	92.56	45	<<0.001
	Mammals	0.118	0.416	0.266	0.200	342.9	66.27	69	0.571
	Tetrapods	0.129	0.454	0.253	0.164	331.7	1363.3	129	<<0.001
	Vertebrates	0.143	0.432	0.245	0.179	333.1	1678.6	183	<<0.001

ISSN: 2730-7182