Skip to main content

Table 1 Accession numbers for the genes used in the phylogenetic analysis.

From: The genomic environment around the Aromatase gene: evolutionary insights

Gene family Gene Accession number Species
AP4E1   NP_031373 H. sapiens
   ENSMUSP00000002063 Mus musculus
   ENSGALP00000007610 Gallus gallus
   SINFRUP00000132389 Fugu rubripes
   GSTENG00025592001 T. nigroviridis
   ENSXETP00000044864 X. tropicalis
   ci0100133154 (scaffold11) C. intestinalis
SSC-S2   ENSANGP00000018260 A. gambiae
  CG4091 AAF47048 D. melanogaster
   ci0100140958 (scaffold 92) C. intestinalis
  A NP_055165 H. sapiens
   ENSMUSP00000034810 M. musculus
   ENSGALP00000007631 G. gallus
   ENSXETP00000044865 X. tropicalis
  B NP_078851 H. sapiens
   NP_081482 M. musculus
   ENSXETP00000017843 X. tropicalis
   SINFRUP00000149825 F. rubripes
   GSTENT00011674001 T. nigroviridis
  C NP_997264 H. sapiens
   ENSMUSP00000034810 M. musculus
   ENSGALP00000007631 G. gallus
   ENSXETP00000044865 X. tropicalis
   SINFRUT00000165316 annotated as pseudogene F. rubripes
   GSTENT00018057001 T. nigroviridis
  D NP_689575 H. sapiens
   ENSMUSP00000076961 M. musculus
   ENSGALP00000006772 G. gallus
   SINFRUP00000156999 F. rubripes
   GSTENT00028868001 T. nigroviridis
Colmedin CG6867 NP_573262 D. melanogaster
  COF-2 AY494975 C. elegans
  unc-122 AY494976 C. elegans
  COL1 NP_861454 H. sapiens
   NP_796324 M. musculus
   ENSGALP00000021668 G. gallus
   ENSXETP00000044876 X. tropicalis
  COL1a SINFRUP00000165325 F. rubripes
   GSTENG00018059001 T. nigroviridis
  COL1b SINFRUP00000132381 F. rubripes
   GSTENT00025590001 T. nigroviridis
DMXL   XP_314464.1 A. gambiae
  DmX NP_572302 D. melanogaster
   CAB01916 C. elegans
   ci0100136505 (scaffold149) C. intestinalis
  DMXL2 ENSGALP00000007662 G. gallus
   NP_056078.1 H. sapiens
   XP_358382.2 M. musculus
   GSTENG00018060001 T. nigroviridis
   SINFRUP00000166673 F. rubripes
   ENSXETP00000044880 X. tropicalis
  DMXL1 ENSGALP00000003481 G. gallus
   CAA06718 H. sapiens
   ENSMUSP00000045559 M. musculus
   GSTENG00030946001 T. nigroviridis
   SINFRUP00000162769 F. rubripes
   ENSXETP00000038136 X. tropicalis
PPBP PPBP1 NP_699205 H. sapiens
   GSTENG00018055001 T. nigroviridis
   SINFRUP00000165314 F. rubripes
   ENSGALP00000007561 G. gallus
   NP_081585 M. musculus
  PPBP2 CAI16380 H. sapiens
   ENSMUSP00000067811 M. musculus
   ENSXETP00000017826 X. tropicalis
   SINFRUP00000149824 F. rubripes
   ENSXETP00000044860 X. tropicalis
   ci0100137161 (scaffold34) C. intestinalis
   XP_321699 A. gambiae
   NP_650352 D. melanogaster
TMOD TMOD AAL13319 C. elegans
  TMOD ( spdo ) AAC04506 D. melanogaster
  TMOD ci0100140287 (scaffold487) C. intestinalis
  TMOD1 NP_003266 H. sapiens
   NP_068683 M. musculus
   NP_990105 G. gallus
   ENSXETP00000022442 X. tropicalis
   GSTENG00033528001 T. nigroviridis
   SINFRUP00000157299 F. rubripes
  TMOD2/3 GSTENG00018054001 T. nigroviridis
   SINFRUP00000165312 F. rubripes
  TMOD2 NP_055363 H. sapiens
   Q9JKK7 M. musculus
   ENSGALP00000007536 G. gallus
   ENSXETP00000044853 X. tropicalis
  TMOD3 NP_055362 H. sapiens
   ENSMUSP00000072087 M. musculus
   ENSGALP00000007492 G. gallus
   ENSXETP00000044845 X. tropicalis
  TMOD4 NP_037485 H. sapiens
   NP_057921 M. musculus
   NP_990105 G. gallus
   SINFRUP00000149822 F. rubripes
   GSTENG00011677001 T. nigroviridis
   ENSXETP00000044853 X. tropicalis
CYP19   NP_112503 H. sapiens
    B. floridae
   AAF04617 D. sabina
   AAK31803 Alligator mississippiensis
   NP_001001761 G. gallus
   P28649 M. musculus
   ENSXETP00000044866 X. tropicalis
  Cyp19a GSTENP00025591001 T. nigroviridis
  Cyp19b GSTENP00018058001 T. nigroviridis
  Cyp19a NP_571229 D. rerio
  Cyp19b NP_571717 D. rerio
  Cyp19a SINFRUP00000132385 F. rubripes
  Cyp19b SINFRUP00000165318 F. rubripes
Others AP3D AAC14585 D. melanogaster
  AP3D1 NP_003929 H. sapiens
  OLFM2 ENSP00000264833 H. sapiens
  CiOLF ci0100131069(scaffold4) C. intestinalis
  Cyp4d2 Z23005 D. melanogaster
  CYP4 ENSMUSP00000003574 M. musculus
  CYP4 ci0100146084 (scaffold15) C. intestinalis