Skip to main content

Table 1 Summary of phylogenetic analyses of Rafflesiales using different data partitions and methods of analysis.

From: Phylogenetic inference in Rafflesiales: the influence of rate heterogeneity and horizontal gene transfer

 

3-Gene*

3-Gene

nuSSU rDNA

nuSSU rDNA

matR

matR

atp1

atp1

 

Parsimony

Bayesian

Parsimony constrained

Likelihood constrained

Parsimony

Likelihood & Bayesian

Parsimony

Likelihood & Bayesian

Mitrastema

Malvales

Ericales

Malvales

Ericales

Ericales

Ericales

Caryophyllales

Caryophyllales

Cytinus

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Bdallophyton

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Apodanthes

N/A

N/A

N/A

N/A

Cucurbitales

Cucurbitales

Polemonium

Polemonium

Pilostyles

Malvales

Malvales

Malvales

Malvales

Cucurbitales

Cucurbitales

Fabales

Fabales

Berlinianche

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

N/A

Ericales/Fabales

Ericales/Fabales

Rafflesia

Malvales

Malpighiales

Malvales

Malpighiales

Malpighiales

Malpighiales

Eudicots

Eudicots

Rhizanthes

Malvales

Malpighiales

Malvales

Malpighiales

Malpighiales

Malpighiales

Eudicots

Eudicots

Sapria

Malvales

Malpighiales

Malvales

Malpighiales

Malpighiales

Malpighiales

Eudicots

Eudicots

  1. *Nuclear SSU rDNA plus chloroplast rbcL &atpB.
  2. Possible HGT events
  3. Long-branch artifact