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Table 3 Sampling of Urbanus bernikerni complex specimens and gene region success

From: Mitochondrial and nuclear phylogenetic analysis with Sanger and next-generation sequencing shows that, in Área de Conservación Guanacaste, northwestern Costa Rica, the skipper butterfly named Urbanus belli(family Hesperiidae) comprises three morphologically cryptic species

Voucher code

Identification

COIseq. length

n

cytbseq. length

n

EF1aseq. length

n/polymorphism

ITS2seq. length

08-SRNP-4727

Urbanus segnestami

658

0n

499

0n

0

N/A

>200 bp

06-SRNP-47955

Urbanus segnestami

658

0n

499

0n

316

0n

>200 bp

06-SRNP-46570

Urbanus segnestami

657

0n

499

0n

1030

5n

>200 bp

06-SRNP-47304

Urbanus segnestami

632

0n

499

0n

316

2n

>200 bp

07-SRNP-41187

Urbanus segnestami

642

1n

499

0n

316

2n

>200 bp

08-SRNP-23800

Urbanus segnestami

658

0n

475

0n

315

2n

>200 bp

08-SRNP-5848

Urbanus segnestami

658

0n

456

0n

316

5n

>200 bp

08-SRNP-65935

Urbanus segnestami

658

0n

443

0n

1045

2n

>200 bp

08-SRNP-1439

Urbanus segnestami

658

0n

499

0n

1030

1n

>200 bp

08-SRNP-65153

Urbanus segnestami

658

0n

441

0n

1045

1n

0

07-SRNP-65582

Urbanus segnestami

658

0n

475

0n

1045

8n

>200 bp

07-SRNP-33232

Urbanus segnestami

658

0n

429

0n

1045

5n

>200 bp

07-SRNP-1119

Urbanus segnestami

658

0n

476

0n

1045

2n

0

07-SRNP-42421

Urbanus segnestami

658

0n

475

0n

1045

2n

0

07-SRNP-45090

Urbanus segnestami

658

0n

499

0n

933

7n

0

08-SRNP-24278

Urbanus segnestami

658

0n

0

N/A

0

N/A

>200 bp

06-SRNP-47801

Urbanus bernikerni

597

0n

499

0n

1030

0n

>200 bp

07-SRNP-30615

Urbanus bernikerni

658

0n

465

0n

541

3n

>200 bp

07-SRNP-20318

Urbanus bernikerni

658

0n

444

0n

0

N/A

>200 bp

06-SRNP-18276

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

0

N/A

>200 bp

07-SRNP-57868

Urbanus bernikerni

658

0n

445

0n

541

0n

>200 bp

03-SRNP-12634.1

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

0

N/A

0

06-SRNP-47816

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

1030

2n

>200 bp

07-SRNP-45071

Urbanus bernikerni

655

0n

499

0n

316

0n

>200 bp

01-SRNP-4475

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

316

1n

>200 bp

06-SRNP-3621

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

0

N/A

0

07-SRNP-40856

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

930

0n

0

07-SRNP-56547

Urbanus bernikerni

658

0n

443

0n

260

3n

>200 bp

07-SRNP-56829

Urbanus bernikerni

658

0n

446

0n

0

N/A

>200 bp

07-SRNP-30613

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

541

3n

>200 bp

07-SRNP-40676

Urbanus bernikerni

658

0n

474

0n

541

1n

0

06-SRNP-47817

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

0

N/A

0

06-SRNP-46460

Urbanus bernikerni

657

0n

499

0n

316

0n

>200 bp

06-SRNP-46639

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

541

1n

0

06-SRNP-6511

Urbanus bernikerni

657

0n

499

0n

316

1n

0

06-SRNP-46572

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

1030

3n

>200 bp

05-SRNP-1832

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

0

N/A

0

02-SRNP-954

Urbanus bernikerni

658

0n

499

0n

316

1n

0

06-SRNP-65065

Urbanus ehakernae

649

0n

499

0n

1045

4n

0

07-SRNP-33182

Urbanus ehakernae

648

0n

499

0n

1045

3n

>200 bp

08-SRNP-65993

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

1045

1n

>200 bp

08-SRNP-66028

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

1045

4n

>200 bp

07-SRNP-33183

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

541

0n

>200 bp

07-SRNP-33184

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

1045

5n

>200 bp

07-SRNP-287

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

316

0n

0

07-SRNP-40761

Urbanus ehakernae

655

0n

499

0n

1045

1n

>200 bp

06-SRNP-46887

Urbanus ehakernae

657

0n

499

0n

316

5n

>200 bp

06-SRNP-46891

Urbanus ehakernae

657

0n

499

0n

1030

11n

>200 bp

05-SRNP-40545

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

541

0n

>200 bp

05-SRNP-41753

Urbanus ehakernae

658

0n

499

0n

316

3n

>200 bp

06-SRNP-43129

Urbanus ehakernae

381

0n

499

0n

1030

2n

>200 bp

07-SRNP-57988

Urbanus evona

658

0n

499

0n

1030

2n

0

05-SRNP-66411

Urbanus evona

658

0n

499

0n

851

0n

>200 bp

04-SRNP-15286

Urbanus evona

658

0n

498

1n

848

3n

0

07-SRNP-1369

Urbanus proteus

658

0n

499

0n

314

2n

0

08-SRNP-71995

Urbanus proteus

658

0n

499

0n

415

4n

0

08-SRNP-21596

Urbanus esmeraldus

658

0n

499

0n

313

3n

0

07-SRNP-57862

Urbanus esmeraldus

658

0n

499

0n

315

1n

0

07-SRNP-57861

Urbanus esmeraldus

658

0n

0

N/A

416

3n

0

06-SRNP-1984

Urbanus esta

658

0n

443

0n

845

6n

0

07-SRNP-56430

Urbanus esta

658

0n

499

0n

848

3n

0

07-SRNP-57988

Urbanus evona

658

0n

499

0n

1030

2n

0

  1. Sequence length and number of ambiguous bases and/or polymorphic positions [n] are included for each specimen.