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Table 2 Twelve haplotypes of C. taliensis identified in the rpl32-trnL sequences

From: Phylogeography of Camellia taliensis (Theaceae) inferred from chloroplast and nuclear DNA: insights into evolutionary history and conservation

Haplotypes

Polymorphic sites

1

8

9

1

1

1

1

2

2

2

3

4

5

6

6

7

7

8

1

4

0

0

0

4

6

1

5

5

6

0

8

1

2

7

8

1

   

1

2

6

3

6

1

6

4

7

6

7

3

3

9

9

C1

-

T

T

A

*

G

-

C

-

C

A

A

G

A

A

C

-

C

C2

T

•

G

•

*

•

-

•

-

•

•

•

•

C

•

•

-

•

C3

-

G

•

•

*

•

-

•

-

•

•

•

•

•

•

•

-

•

C4

-

•

•

•

*

•

-

•

-

•

C

•

•

•

•

•

-

•

C5

-

•

•

•

*

•

-

•

-

•

•

•

•

•

•

T

-

•

C6

-

•

•

•

*

•

-

•

-

T

•

•

•

•

•

•

-

•

C7

-

G

•

C

*

T

-

T

-

•

•

T

•

•

•

•

-

•

C8

-

•

•

•

-

•

-

•

-

•

•

•

•

•

•

•

-

•

C9

-

•

G

•

*

•

A

•

-

•

•

•

T

•

C

•

-

T

C10

-

G

•

C

*

•

-

•

T

•

•

•

•

•

•

•

-

•

C11

-

G

•

C

*

•

-

•

-

•

•

•

•

•

•

•

-

•

C12

-

•

G

•

*

•

-

•

-

•

•

•

•

•

•

•

#

•

  1. The number at the top indicates polymorphic sites. Indels are numbered according to the first position in which they occur. Dots represent nucleotide variants identical to the first sequence; - indicates absence; *and # denote two indels (AAATA and AAATATCTA).
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BMC Ecology and Evolution

ISSN: 2730-7182

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