Skip to main content

Table 2 Structural features of the 10 new mitochondrial genomes

From: Ten new complete mitochondrial genomes of pulmonates (Mollusca: Gastropoda) and their impact on phylogenetic relationships

  Auriculinella
bidentata
Myosotella
myosotis
Ovatella
vulcani
Pedipes
pedipes
Peronia
peronii
Salinator
rhamphidia
Succinea
putris
Rhopalocaulis
grandidieri
Trimusculus
reticulatus
Siphonaria
gigas
Total
size
14, 135 14, 215 14, 274 16, 708 13, 968 14, 007 14, 092 14, 523 14, 044 14, 518
%A 25.8 25.2 25.0 28.6 27.1 26.7 33.8 29.3 26.4 24.3
%T 30.9 32.5 29.7 33.7 37.3 35.6 42.9 33.9 34.7 37.2
%C 20.4 20.3 21.6 18.4 15.4 16.9 10.8 19.7 18.2 15.1
%G 22.6 22.0 23.7 19.3 20.3 20.8 12.1 17.1 20.6 23.4
%A+T 56.7 57.7 54.7 62.3 64.4 62.3 76.7 63.2 61.1 61.5
POR 44 46 44 ? (397) 54 44 47 42 47 72
rrnL 1, 037 1, 041 1, 057 1, 138 1, 033 1, 025 1, 020 1, 006 1, 057 1, 109
rrnS 704 714 711 786 714 714 755 716 719 755
cob 1, 111 (TTG/T) 1, 110 (TTG/TAG) 1, 110 (TTG/TAA) 1, 108 (TTG/T) 1, 108 (TTG/T) 1, 111 (TTG/T) 1, 107 (TTG/TAG) 1, 068 (TTG/TAG) 1, 110 (TTG/TAA) 1, 125 (TTG/TAA)
cox1 1, 533 (TTG/TAA) 1, 527 (ATG/TAA) 1, 533 (TTG/TAA) 1, 527 (TTG/TAA) 1, 525 (TTG/T) 1, 527 (TTG/TAA) 1, 548 (TTG/TAG) 1, 527 (TTG/TAA) 1, 527 (TTG/TAG) 1, 530 (GTG/TAG)
cox2 687 (TTG/TAG) 669 (GTG/TAA) 666 (TTG/TAG) 681 (GTG/TAA) 666 (TTG/TAA) 664 (GTG/T) 649 (ATG/T) 634 (TTG/T) 666 (TTG/TAA) 672 (GTG/TAA)
cox3 778 (ATG/T) 780 (ATG/TAG) 778 (ATG/T) 780 (GTG/TAG) 804 (ATG/T) 781 (ATG/T) 783 (ATG/TAG) 772 (ATG/T) 778 (ATG/T) 810 (ATG/TAA)
nad1 906 (GTG/TAA) 906 (TTG/TAG) 906 (TTG/TAA) 903 (ATG/TAG) 906 (TTG/TAA) 958 (TTG/T) 916 (TTG/T) 919 (TTG/T) 906 (TTG/TAA) 903 (TTG/TAA)
nad2 945 (ATG/TAG) 948 (ATG/TAG) 942 (CTG/T) 927 (ATG/TAA) 939 (GTG/TAG) 925 (TTG/T) 975 (TTG/TAA) 915 (GTG/TAA) 916 (TTG/T) 942 (ATG/TAA)
nad3 354 (TTG/TAA) 349 (TTG/TAA) 354 (TTG/TAA) 372 (ATG/TAA) 327 (ATT/TAA) 349 (TTG/T) 352 (ATG/T) 351 (GTG/TAA) 357 (ATG/TAG) 361 (ATG/T)
nad4 1, 311 (TTG/TAG) 1, 305 (TTG/TAA) 1, 308 (TTG/TAG) 1, 302 (ATG/TAG) 1, 318 (TTG/T) 1, 311 (TTG/TAG) 1, 326 (ATG/TAA) 1, 308 (ATG/TAA) 1, 306 (TTG/T) 1, 324 (TTG/T)
nad4L 327 (TTG/TAG) 291 (TTG/TAA) 286 (TTG/T) 288 (GTG/TAG) 283 (ATG/T) 279 (TTG/TAG) 275 (ATA/TA) 274 (TTG/T) 286 (ATG/T) 294 (GTG/TAA)
nad5 1, 665 (ATA/TAG) 1, 689 (ATA/TAG) 1, 671 (TTG/TAG) 1, 701 (ATG/TAG) 1, 671 (TTG/TAG) 1, 671 (TTG/TAG) 1, 680 (ATG/TAA) 1, 662 (ATT/TAA) 1, 680 (TTG/TAG) 1, 674 (GTG/TAA)
nad6 483 (ATT/TAA) 477 (TTG/TAA) 480 (ATT/TAG) 462 (TTG/TAA) 468 (ATT/TAA) 474 (TTG/TAA) 453 (ATG/TAA) 450 (ATG/TAG) 456 (TTG/TAG) 489 (ATT/TAG)
atp6 643 (GTG/T) 645 (ATG/TAG) 645 (GTG/TAG) 642 (ATG/TAG) 642 (TTG/TAA) 643 (ATG/T) 657 (ATG/TAA) 618 (ATG/TAA) 643 (ATG/T) 657 (ATG/TAA)
atp8 157 (GTG/T) 153 (ATG/TAG) 159 (ATG/TAG) 153 (ATG/TAA) 153 (ATG/TAA) 151 (ATG/T) 123 (TTG/TAA) 151 (GTG/T) 186 (ATG/TAG) 162 (ATG/TAA)
  1. The size of each genome and the POR are in bp. Start and stop codons for protein-coding genes are indicated in parentheses.