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Table 1 Alleles of MML0050 locus in the Rv0050 gene from M. tuberculosis

From: Perspective on sequence evolution of microsatellite locus (CCG)n in Rv0050 gene from Mycobacterium tuberculosis

Alleles

Sequences

Mutation patterns

Strains

  

Insertion

Deletion

Substitution

 

Rv0050*01

------------------CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCG

   

H37Rv

Rv0050*02

------------------CCGCCGCCGCCGCCGCCGTCG

  

C→T

H37Ra, CDC1551, KZN1435

Rv0050*03

------------------------CCGCCGCCGCCGCCGTCG

 

1 motif

C→T

clone Y219

Rv0050*04

------------CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCG

1 motif

 

C→T

F11

Rv0050*05

------CCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGTCG

2 motifs

 

C→T

 

Rv0050*06

------CCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGTCG

2 motifs

 

G→T; C→T

M. Bovis

Rv0050*07

CCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGTCG

3 motifs

 

G→T; C→T

M. Bovis BCG