The sequence, structure and evolutionary features of HOTAIR in mammals

Table 1 Distribution of hits of queries in human, chimpanzee, mouse, rat and platypus

	human		chimp		mouse		rat		platypus
Query1	79a		84a		62a		42a		28a
	13b	1c	18b	0c	10b	1c	12b	0c	3b	0c
	0d	22e	0d	16e	0d	15e	0d	5e	0d	2e
	42f	1g	50f	0g	37f	0g	25f	0g	23f 0g
Query2	90a		83a		69a		68a		103a
	21b	1c	15b	0c	24b	0c	10b	0c	9b	0c
	0d	26e	0d	19e	0d	12e	2d	7e	1d	17e
	40f	2g	49f	0g	32f	1g	49f	0g	76f	0g
Query3	56a		60a		111a		119a		125a
	11b	2c	8b	0c	23b	0c	10b	0c	1b	0c
	0d	12e	0d	8e	0d	13e	1d	14e	0d	16e
	31f	0g	44f	0g	75f	0g	94f	0g	108f	0g
Query4	17a		14a		10a		14a		12a
	3b	0c	1b	0c	3b	0c	3b	0c	0b	0c
	0d	5e	1d	4e	0d	3e	0d	2e	0d	2e
	9f	0g	8f	0g	4f	0g	9f	0g	10f	0g
Query5	13a		16a		27a		14a		43a
	4b	0c	3b	0c	2b	0c	0b	0c	5b	0c
	0d	3e	0d	3e	0d	6e	0d	1e	0d	0e
	6f	0g	10f	0g	19f	0g	13f	0g	38f	0g
Query6	15a		17a		10a		14a		0a
	1b	0c	0b	0c	1b	0c	1b	0c
	0d	2e	0d	0e	0d	2e	0d	0e
	12f	0g	17f	0g	7f	0g	13f	0g
Query6	69a		79a		99a		274a		23a
a	12b	0c	10b	0c	20b	2c	18b	0c	0b	0c
	0d	24e	0d	19e	0d	17e	0d	28e	0d	3e
	32f	1g	50f	0g	59f	1g	126f	0g	20f	0g
Query6	76a		102a		81a		90a		45a
b	15b	1c	12b	0c	27b	1c	17b	0c	5b	0c
	0d	17e	0f	16e	0d	7e	1d	7e	1d	1e
	42f	1g	74f	0g	45f	1g	65f	0g	38f	0g

a: the total number of hits, b: the number of hits in introns, c: the number of hits in novel transcripts or known ncRNAs, d: the number of hits in exons of protein coding genes, e: the number of hits antisense to a gene, f: the number of intergenic hits, g: the number of hits in the 3'UTR or 5'UTR of genes.

ISSN: 2730-7182