| V. ellipsiformis Female | V. ellipsiformis Male | P. grandis Female | P. grandis Male | I. japanensis Female | I. japanensis Male | Q. quadrula Female | Q. quadrula Male |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Total size | 15 975 | 17 174 | 15 848 | 17 071 | 16 826 | 16 966 | 16 033 | 16 970 |
pb | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
A+T % | 62.55 | 63.47 | 64.22 | 64.76 | 57.20 | 57.12 | 61.94 | 61.80 |
Strand - CG-skew | -0.46 | -0.49 | -0.36 | -0.33 | -0.42 | -0.41 | -0.48 | -0.51 |
Strand - AT-skew | -0.40 | -0.41 | -0.30 | -0.25 | -0.41 | -0.41 | -0.44 | -0.43 |
Strand + CG-skew | 0.32 | 0.31 | 0.28 | 0.25 | 0.26 | 0.30 | 0.33 | 0.38 |
Strand + AT-skew | -0.06 | 0.04 | -0.09 | -0.08 | 0.00 | 0.05 | -0.02 | 0.10 |
rrnS | 865 | 859 | 847 | 841 | 844 | 864 | 857 | 865 |
rrnL | 1271 | 1290 | 1271 | 1287 | 1304 | 1325 | 1297 | 1306 |
cox1 | 1542 (TTG/TAG) | 1537 (GTG/T**) | 1539 (TTG/TAA) | 1537 (CTG/T**) | 1539 (GTG/TAA) | 1543 (TTG/T**) | 1542 (TTG/TAG) | 1534 (GTG/T**) |
cox2 | 684 (ATG/TAA) | 1233 (ATG/TAA) | 681 (ATG/TAG) | 1251 (ATG/TAG) | 681 (ATG/TAA) | 1224 (ATG/TAG) | 681 (ATG/TAG) | 1230 (ATG/TAG) |
Nd3 | 357 (ATG/TAG) | 354 (ATG/TAA) | 357 (ATG/TAA) | 357 (TTG/TAA) | 381 (ATG/TAA) | 360 (ATG/TAG) | 360 (ATA/TAA) | 366 (ATT/TAA) |
Nd2 | 972 (ATG/TAG) | 957 (ATT/TAA) | 966 (ATG/TAG) | 972 (ATT/TAA) | 960 (ATG/TAA) | 981 (ATA/TAG) | 966 (ATG/TAA) | 990 (ATC/TAA) |
cob | 1156 (ATT/T**) | 1158 (ATG/TAA) | 1146 (ATC/TAA) | 1149 (TTG/TAA) | 1152 (ATT/TAA) | 1152 (GTG/TAA) | 1152 (ATC/TAA) | 1149 (ATG/TAA) |
Nd5 | 1731 (ATA/TAA) | 1758 (ATA/TAA) | 1737 (GTG/TAG) | 1740 (ATA/TAA) | 1704 (GTG/TAG) | 1765 (TTA/T**) | 1734 (ATG/TAA) | 1770 (ATG/TAA) |
Nd1 | 903 (ATC/TAA) | 903 (ATA/TAA) | 900 (ATA/TAA) | 897 (GTG/TAA) | 897 (ATC/TAG) | 879 (ATA/TAA) | 894 (ATA/TAA) | 912 (ATG/TAA) |
Nd6 | 489 (ATT/TAA) | 456 (ATA/TAG) | 489 (ATC/TAA) | 405 (ATA/TAA) | 489 (ATC/TAA) | 528 (ATA/TAG) | 498 (ATG/TAA) | 522 (ATA/TAG) |
Nd4 | 1347 (ATT/TAG) | 1350 (ATG/TAG) | 1344 (ATT/TAA) | 1347 (GTG/TAA) | 1374 (GTG/TAA) | 1362 (ATT/TAG) | 1332 (TTT/TAA) | 1380 (ATG/TAA) |
Nd4l | 297 (GTG/TAG) | 297 (TTG/TAA) | 297 (GTG/TAG) | 264 (ATA/TAG) | 297 (GTG/TAA) | 309 (ATA/TAG) | 294 (GTG/TAG) | 297 (ATG/TAG) |
atp8 | 210 (GTG/TAA) | 174 (GTG/TAG) | 225 (ATG/TAA) | Remnant | Remnant 96 (GTG/TAG) | 181 (ATG/T**) | 159 (ATG/TAA) | 123 (GTG/TAA) |
atp6 | 708 (ATG/TAG) | 696 (ATG/TAA) | 714 (ATG/TAG) | 690 (ATG/TAA) | 708 (ATG/TAG) | 663 (ATG/TAG) | 708 (ATG/TAG) | 678 (ATA/TAG) |
cox3 | 780 (ATG/TAG) | 774 (ATT/TAA) | 780 (ATG/TAA) | 772 (ATG/T**) | 795 (ATA/TAA) | 810 (GTG/TAA) | 780 (ATG/TAG) | 777 (ATT/TAA) |