Skip to main content

Table 2 Comparison of gene length, initiation codon and termination codon in Crassostrea mt genomes

From: Unusual conservation of mitochondrial gene order in Crassostreaoysters: evidence for recent speciation in Asia

 

Cgi

Can

Csi

Cho

Car

Cvi

Cgi

Can

Csi

Cho

Car

Cvi

Cgi

Can

Csi

Cho

Cai

Cvi

cox1

538

538

538

538

538

540

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAG

TAG

TAA

TAA

TAA

TAA

cox2

233

233

233

233

233

230

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAA

TAG

TAA

TAG

TAG

TAA

cox3

291

291

291

287

287

290

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATA

TAG

TAA

TAG

TAA

TAA

TA-

nad1

311

311

311

311

311

311

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAA

TAA

TAA

TAA

TAA

TAA

nad2

332

332

332

332

332

331

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAG

TAG

TAA

TAG

TAG

TAA

nad3

116

116

116

116

116

117

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAG

TAG

TAG

TAG

TAA

TAA

nad4

450

449

449

449

449

449

ATG

ATG

ATG

ATA

ATG

ATG

TAA

TAA

TAG

TAG

TAG

TAA

nad4L

94

94

94

93

94

93

ATG

ATG

ATA

ATG

ATA

ATG

T-

T-

T-

T-

T-

T-

nad5

556

556

557

556

556

555

ATG

ATG

ATG

ATG

GTG

ATG

TAG

TAG

TAG

TAA

TAG

TAA

nad6

158

158

158

158

159

153

ATG

ATG

ATG

ATT

ATG

ATG

TAG

TAG

TAG

TA-

TAA

TAA

cob

412

412

411

401

400

403

CTA

CTA

CTG

ATA

TTA

TTA

TAG

TAG

TAA

TAA

TAA

TAG

atp6

227

227

227

227

224

224

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

ATG

TAA

TAA

TAG

TAG

TAG

TAA

rrnL 1 *

601

602

602

605

606

748

            

rrnL 2 *

713

713

712

712

712

721

            

rrnS 1 *

1037

1038

1037

1074

1070

989

            

rrnS 2 *

1205

1206

1195

1190

1183

0

            
  1. *rrnL 1 and rrnL 2 indicate the two parts of 5' half and 3'half rrnL, respectively; rrnS 1 and rrnS 2 indicate the duplication of rrnS.