Skip to main content

Table 3 Rate of C-to-T change in edited sites (ES) and in 3rd codon positions

From: Are substitution rates and RNA editing correlated?

  Taxa ccmB cob mtt2 nad5
   ES 3rd ES 3rd ES 3rd ES 3rd
ALI Alisma 0.52 0.025 0.79 0.037 0.07 0.063 0.95 0.031
  Baldellia 0.52 0.025 0.79 0.037 0.07 0.063 0.95 0.031
  Caldesia 0.52 0.050 0.93 0.019 0.07 0.063 0 0.031
  Echinodorus 0.52 0.025 1.0 0.019 0.59 0.123 0 0.031
  Luronium 0.52 0.025 0.79 0.037 0.07 0.063 0.95 0.031
  Ranalisma 0.52 0.025 1.0 0.037 0.07 0.063 0 0.031
  Sagittaria 0.52 0.025 0.86 0.037 0.07 0.063 0 0.031
LIM Hydrocleys 0.79 0.025 0.71 0.037 0.48 0.093 0 0.031
  Limnocharis 0.55 0.025 0.71 0.037 0.07 0.063 0 0.031
CYM Amphibolis 0.05 0 0.36 0.099 0.07 0.097 0.26 0.062
  Cymodocea 0.02 0 0.36 0.079 0.07 0.097 0.26 0.062
  Syringodeum 0.02 0 0.36 0.099 0.07 0.097 0.26 0.062
POS Posidonia 0 0 0.14 0.079 0.07 0.097 0.10 0.062
RUP Ruppia 0.16 0.050 0.36 0.206 0.15 0.161 0.47 0.125
ZOS Heterozostera 0 0.025 0.14 0.140 0.15 0.224 0.17 0.047
  Phyllospadix 0 0 0.14 0.120 0.15 0.224 0.17 0.047
  Zostera 0.02 0 0.14 0.120 0.15 0.224 0.17 0.047
POT Potamogeton 0.04 0 0 0.099 0.15 0.128 0.17 0.047
  Zanichellia 0.04 0.025 0 0.099 0.15 0.159 0.17 0.047
JUN Lilaea 0.07 0 0 0.059 0.15 0.160 0.17 0.047
  Triglochin 0.02 0.025 0 0.039 0.22 0.161 0.17 0.047
SCH Scheuchzeria 0.04 0.025 0 0.059 0.07 0.097 0 0
APO Aponogeton 0.02 0.025 0 0.059 0.07 0.096 0 0.017
BUT Butomus - - 0 0.059 0.04 0.094 0.05 0.017
HYD Blyxa - - 1.0 0.059 0.07 0 0.16 0.017
  Egeria 0.15 0 1.0 0.039 0.22 0 0.89 0.017
  Elodea 0.17 0 1.0 0.039 - - 0.89 0.017
  Halophila - - 1.0 0.223 0.96 0.092 1.0 0.078
  Hydrilla 0.15 0.025 1.0 0.119 0.52 0.029 1.0 0.031
  Najas 0.09 0 1.0 0.139 0.29 0 1.0 0.078
  Nechamandra 0.33 0 1.0 0.119 0.30 0 1.0 0.031
  Ottelia - - 1.0 0.059 0.07 0 1.0 0.016
  Stratiotes - - 0 0.079 0.04 0 0.11 0.047
  Vallisneria 0.33 0 1.0 0.119 0.30 0 1.0 0.047
  1. In bold p ≤ 0.001 in the Fisher exact test.