Skip to main content

Table 3 Rate of C-to-T change in edited sites (ES) and in 3rd codon positions

From: Are substitution rates and RNA editing correlated?

 

Taxa

ccmB

cob

mtt2

nad5

  

ES

3rd

ES

3rd

ES

3rd

ES

3rd

ALI

Alisma

0.52

0.025

0.79

0.037

0.07

0.063

0.95

0.031

 

Baldellia

0.52

0.025

0.79

0.037

0.07

0.063

0.95

0.031

 

Caldesia

0.52

0.050

0.93

0.019

0.07

0.063

0

0.031

 

Echinodorus

0.52

0.025

1.0

0.019

0.59

0.123

0

0.031

 

Luronium

0.52

0.025

0.79

0.037

0.07

0.063

0.95

0.031

 

Ranalisma

0.52

0.025

1.0

0.037

0.07

0.063

0

0.031

 

Sagittaria

0.52

0.025

0.86

0.037

0.07

0.063

0

0.031

LIM

Hydrocleys

0.79

0.025

0.71

0.037

0.48

0.093

0

0.031

 

Limnocharis

0.55

0.025

0.71

0.037

0.07

0.063

0

0.031

CYM

Amphibolis

0.05

0

0.36

0.099

0.07

0.097

0.26

0.062

 

Cymodocea

0.02

0

0.36

0.079

0.07

0.097

0.26

0.062

 

Syringodeum

0.02

0

0.36

0.099

0.07

0.097

0.26

0.062

POS

Posidonia

0

0

0.14

0.079

0.07

0.097

0.10

0.062

RUP

Ruppia

0.16

0.050

0.36

0.206

0.15

0.161

0.47

0.125

ZOS

Heterozostera

0

0.025

0.14

0.140

0.15

0.224

0.17

0.047

 

Phyllospadix

0

0

0.14

0.120

0.15

0.224

0.17

0.047

 

Zostera

0.02

0

0.14

0.120

0.15

0.224

0.17

0.047

POT

Potamogeton

0.04

0

0

0.099

0.15

0.128

0.17

0.047

 

Zanichellia

0.04

0.025

0

0.099

0.15

0.159

0.17

0.047

JUN

Lilaea

0.07

0

0

0.059

0.15

0.160

0.17

0.047

 

Triglochin

0.02

0.025

0

0.039

0.22

0.161

0.17

0.047

SCH

Scheuchzeria

0.04

0.025

0

0.059

0.07

0.097

0

0

APO

Aponogeton

0.02

0.025

0

0.059

0.07

0.096

0

0.017

BUT

Butomus

-

-

0

0.059

0.04

0.094

0.05

0.017

HYD

Blyxa

-

-

1.0

0.059

0.07

0

0.16

0.017

 

Egeria

0.15

0

1.0

0.039

0.22

0

0.89

0.017

 

Elodea

0.17

0

1.0

0.039

-

-

0.89

0.017

 

Halophila

-

-

1.0

0.223

0.96

0.092

1.0

0.078

 

Hydrilla

0.15

0.025

1.0

0.119

0.52

0.029

1.0

0.031

 

Najas

0.09

0

1.0

0.139

0.29

0

1.0

0.078

 

Nechamandra

0.33

0

1.0

0.119

0.30

0

1.0

0.031

 

Ottelia

-

-

1.0

0.059

0.07

0

1.0

0.016

 

Stratiotes

-

-

0

0.079

0.04

0

0.11

0.047

 

Vallisneria

0.33

0

1.0

0.119

0.30

0

1.0

0.047

  1. In bold p ≤ 0.001 in the Fisher exact test.